Bien évidemment le développement implique de la matière grise :-) Je parle ici plus de la perception des clients finaux de type TPE qui baignent dans le discours ambiant du type "la technique c'est gratuit puisque qu'Open Source" ou "sous-traitez au VietNam, en Inde ou à Madagascar...". Les agences web sont de mon point de vue mal équipées pour valoriser le développement spécifique et sa maintenance dans la durée car c'est le métier des SSII/SSLL. Je constate avec 10 ans de recul et une étude de marché qui m'a permis de lever des fonds que celles qui s'en sortent sont les agences qui ont su valoriser leurs prestations à forte valeur ajoutée et/ou qui se sont spécialisées.
Celles qui cachent leurs prestations de conseil dans la ligne "hébergement" sont en sursis car l'hébergement est à la baisse... (c’est un exemple que j’ai souvent rencontré).
Monter les prix de la technique est plus simple, tout comme baisser les prix plutôt que de négocier avec le prospect, quitte à en perdre plus. Mon expérience montre cependant que c'est un mauvais calcul à moyen terme. Peu de chance de créer une vraie image de marque pour l'agence par ce biais, peu de chance de créer une relation de confiance, l'agence restera totalement à la merci de la fluctuation du marché et des désidératas des clients.
Concernant les plateformes hébergées on peut bien évidemment calculer un retour sur investissement, tout autant que sur un logiciel qui s'installe... le client n'est certes pas propriétaire des murs mais bien propriétaire de son fonds de commerce (ses données) qu'il peut exporter à tout moment.
Je connais plein de propriétaires de boutiques OSCommerce qui souhaiteraient plutôt être locataires en ce moment parce qu'entre pouvoir évoluer en théorie et pouvoir le faire en pratique il y a une différence énorme... Si la pierre reste une valeur sûre dans laquelle on peut investir sur plusieurs dizaines d’années ce qui justifie une démarche « d’achat » plutôt que de location, en matière de logiciel de création de site il n’en va pas forcément de même au vu de la rapidité d’évolution du domaine.